Linux — nie jako jądro, ale platforma — jest bardzo problematyczny dla samodzielnych programistów i firm niezwiązanych z dystrybucjami, ponieważ jest różnorodny i szybko się zmienia. Linux Application Checker (AppChecker) ma ten problem zredukować.

Fedora i Ubuntu to dystrybucje Linuksa prawie identyczne. “Prawie”, bo każda dystrybucja ma swoje specyficzne cechy i pomimo, iż w większości są zbudowane na tym samym oprogramowaniu, występują poważne problemy z kompatybilnością. Lekarstwem ma być nowa wersja standardu LSB 4.

Linux Foundation opublikowała specyfikację Linux Standard Base 3.2, która ma zapewnić podstawową zgodność między różnymi dystrybucjami Linuksa. Nowa wersja wciąga do formalnego standardu coraz więcej powszechnie używanych mechanizmów.